Vous cherchez un logiciel de comptabilité pour votre entreprise suisse ? Le choix en 2026 est plus vaste que jamais - et les écarts de prix sont considérables : de CHF 0 à plus de CHF 100 par mois pour des fonctions qui semblent similaires.
Nous avons comparé 9 outils suisses : prix, QR-factures, comptabilité en partie double, import bancaire, fonctions IA et TVA. Transparence d'abord : ce comparatif vient de LumaBill. Nous vous disons quand même honnêtement quand un autre outil vous convient mieux - vous pouvez le vérifier dans chaque section, tous les prix proviennent des sites des éditeurs (au 10 juin 2026).
Ce qui compte dans un logiciel de comptabilité suisse
Un logiciel de comptabilité pour la Suisse doit maîtriser quatre choses : les QR-factures suisses (seul standard de bulletin de versement valable depuis octobre 2022), les taux de TVA suisses (8.1% taux normal, 2.6% réduit, 3.8% hébergement), l'import bancaire via fichiers camt ou connexion bancaire et - selon la forme juridique - la comptabilité en partie double selon l'OR (Code des obligations).
Les principaux seuils légaux :
- CHF 100'000 de chiffre d'affaires annuel : l'assujettissement à la TVA commence (Art. 10 MWSTG, loi sur la TVA)
- CHF 500'000 de chiffre d'affaires annuel : la comptabilité en partie double devient obligatoire (Art. 957 OR) ; en dessous, la comptabilité simplifiée (Milchbüechli) suffit
- Sàrl et SA : comptabilité en partie double toujours obligatoire, quel que soit le chiffre d'affaires
Le grand tableau comparatif
| Outil | Dès CHF/mois* | QR-facture | Partie double | Import bancaire | Justificatifs IA | Langues |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LumaBill | 7.50 | Oui | Dès CHF 19 | camt.053 (dès CHF 19) | Dès CHF 29 | de/en/fr/it |
| bexio | 35 | Oui | Oui | Oui | Oui (dès Advanced) | de/fr/it/en |
| MILKEE | 24.90 | Oui | Dès CHF 34.90 | Oui (automatique) | 120 scans/an | de |
| Magic Heidi | 25 | Oui | Non | Oui | Oui | de/fr/it/en |
| Pfeffersack | 5 | Oui | Oui | Oui | Suggestions d'écritures | de |
| einzly | 6.67 | Oui | Non | camt.053 | Oui | de/fr/it/en |
| HelvetiBill | 12 | Oui | Non | Non | Non | de |
| CashCtrl | 0 | Oui | Oui | PRO uniquement (CHF 340/an) | Non | de/en |
| Banana | 0 / CHF 89 par an | Oui | Oui | Règles d'import (Advanced) | Non | de/fr/it/en + |
*Plan payant le moins cher en paiement annuel ; CashCtrl et Banana ont des versions gratuites permanentes. Toutes les données proviennent des sites des éditeurs, au 10 juin 2026.
Les outils en détail
LumaBill - factures plus vraie comptabilité avec IA
LumaBill combine des QR-factures illimitées (dès CHF 9/mois, CHF 7.50 en abonnement annuel) avec une vraie comptabilité en partie double, l'import bancaire camt.053, le compte de résultat, le bilan et le décompte TVA (Pro, CHF 19/mois). Avec Pro + IA (CHF 29/mois) s'ajoutent la reconnaissance IA des justificatifs, la catégorisation IA des dépenses et le rapprochement bancaire IA. Unique dans ce comparatif : un serveur MCP natif qui vous permet de piloter votre comptabilité directement depuis Claude, ChatGPT ou Cursor.
Points forts : rapport qualité-prix (comptabilité complète dès CHF 19), quatre langues, plusieurs profils d'entreprise dans un seul compte, fonctions IA, export d'audit conforme GeBüV. Points faibles : plus jeune et moins d'intégrations que bexio, pas de comptabilité salariale, web app au lieu d'apps mobiles natives.
Fait pour vous si vous êtes indépendant, entreprise individuelle ou petite Sàrl et voulez factures et comptabilité dans un seul outil, sans payer les prix de bexio.
bexio - le leader pour les PME
bexio est le logiciel business suisse le plus connu, avec plus de 100'000 clients et un grand réseau de fiduciaires. Depuis la refonte des forfaits de mars 2026, l'entrée de gamme (Basic, 1 utilisateur) coûte CHF 35/mois en paiement annuel, et les forfaits les plus choisis, Advanced et Optima, CHF 42 et CHF 69.
Points forts : écosystème immense (fiduciaires, intégrations, comptabilité salariale), bien établi, nombreuses interfaces. Points faibles : prix (4-5x plus cher que l'entrée de gamme de LumaBill ou einzly), souvent surdimensionné pour les très petites entreprises, export des données payant après la fin du contrat.
Fait pour vous si vous êtes une PME en croissance avec plusieurs collaborateurs et que votre fiduciaire travaille avec bexio. Détails : LumaBill vs bexio.
MILKEE - Milchbüechli avec connexion bancaire
MILKEE se concentre sur les indépendants avec une comptabilité simple. Basic (CHF 24.90/mois en annuel) comprend la comptabilité simplifiée (Milchbüechli), les QR-factures, une connexion bancaire automatique et 120 scans IA de justificatifs par an. La partie double, la TVA et le multi-devises ne sont disponibles qu'à partir de Business (CHF 34.90/mois).
Points forts : utilisation très simple, connexion bancaire automatique (pas d'upload de fichiers), accès fiduciaire. Points faibles : allemand uniquement, scans IA limités dans le plan Basic (120/an), partie double et TVA coûtent CHF 34.90/mois - presque le double de LumaBill Pro.
Fait pour vous si vous dirigez une entreprise individuelle germanophone et voulez une simplicité maximale avec rapprochement bancaire automatique. Détails : LumaBill vs MILKEE.
Magic Heidi - app de facturation avec apps natives
Magic Heidi (CHF 25/mois en annuel, plan gratuit avec 3 factures) est une app de facturation et de notes de frais conçue spécialement pour les freelances, avec des apps natives pour iOS, Android, macOS et Windows ainsi que le scan IA des justificatifs inclus. Magic Heidi n'offre pas de véritable comptabilité (compte de résultat, bilan, partie double).
Points forts : apps natives sur toutes les plateformes, scan IA compris dans le prix, très accessible aux débutants, entrée gratuite. Points faibles : pas de partie double ni de rapports de clôture, un seul tarif (CHF 25/mois), pas de gestion multi-entreprises.
Fait pour vous si vous n'avez besoin que de factures et de notes de frais et travaillez beaucoup en mobilité. Détails : LumaBill vs Magic Heidi.
Pfeffersack - le casseur de prix
Pfeffersack coûte CHF 5/mois en abonnement annuel (CHF 7 en mensuel) et offre étonnamment beaucoup : QR-factures, partie double, import bancaire (UBS, ZKB, PostFinance, camt), taux de TVA, saisie du temps et accès en lecture pour la fiduciaire.
Points forts : prix imbattable, saisie du temps incluse, modèles par branche. Points faibles : allemand uniquement, IA limitée aux suggestions d'écritures (pas de scan de justificatifs), équipe et écosystème plus petits.
Fait pour vous si le budget est votre critère principal et que vous travaillez en allemand.
einzly - bon marché pour les entreprises individuelles
einzly (Basis dès CHF 6.67/mois en abonnement annuel) s'adresse explicitement aux entreprises individuelles et indépendants en dessous de CHF 500'000 de chiffre d'affaires : QR-factures illimitées, offres, notes de frais, rappels, TVA (méthode effective et taux de la dette fiscale nette) et rapprochement bancaire camt.053. Pas de partie double.
Points forts : prix bas, quatre langues, TVA y compris la méthode du taux de la dette fiscale nette, scan IA des justificatifs. Points faibles : pas de comptabilité en partie double (choix délibéré), donc pas une option pour les Sàrl/SA ou les entreprises en croissance.
Fait pour vous si vous dirigez une petite entreprise individuelle et êtes sûr de ne jamais avoir besoin de la partie double.
HelvetiBill - facturation pure
HelvetiBill (Pro CHF 12/mois, max. 10 factures/mois ; Pro+ CHF 24/mois illimité) est un pur outil de facturation avec QR-factures, offres et gestion des clients. Comptabilité, import bancaire et IA manquent complètement.
Points forts : simple, portail client, QR-factures conformes SIX. Points faibles : limites strictes en entrée de gamme (10 factures/mois), pas de comptabilité, pas d'import bancaire, allemand uniquement.
Fait pour vous si vous émettez très peu de factures et ne voulez délibérément pas d'outil de comptabilité.
CashCtrl - partie double gratuite
CashCtrl est le seul fournisseur à proposer une comptabilité en partie double complète et gratuite en permanence, avec QR-factures, débiteurs/créanciers et rapports (1 utilisateur, 1 organisation). L'import bancaire (ISO 20022/MT940), les devises étrangères, les salaires et l'API ne sont disponibles qu'avec PRO pour CHF 340/an.
Points forts : plan gratuit sans limite de temps, base comptable solide, apprécié des fiduciaires. Points faibles : import bancaire seulement dans PRO, pas de scan IA des justificatifs, maniement plutôt comptable que grand public.
Fait pour vous si vous avez des connaissances comptables et cherchez un grand livre gratuit et solide.
Banana - le classique desktop
Banana Accounting (Professional CHF 89/an, gratuit jusqu'à 70 lignes d'écritures) est un logiciel desktop avec partie double, TVA, multi-devises et facturation. Banana est une référence depuis des décennies auprès des associations, écoles et très petites entreprises.
Points forts : abonnement annuel unique au lieu d'une mensualité, fonctionne en local (pleine souveraineté des données), très flexible (esprit tableur). Points faibles : pas de collaboration cloud, pas de rapprochement bancaire automatique dans le plan de base, pas d'IA, support payant.
Fait pour vous si vous voulez une solution locale et que l'approche tableur ne vous dérange pas - typique pour les associations.
Quel logiciel de comptabilité pour qui ?
Entreprise individuelle sous CHF 500'000 de chiffre d'affaires, simplicité avant tout : LumaBill Starter (CHF 9), einzly (CHF 6.67) ou Pfeffersack (CHF 5). La comptabilité simplifiée (Milchbüechli) suffit légalement.
Entreprise individuelle ou Sàrl avec vraie comptabilité (bilan, compte de résultat, TVA) : LumaBill Pro (CHF 19) est la voie complète la moins chère ; CashCtrl Free si vous pouvez vous passer de l'import bancaire ; MILKEE Business (CHF 34.90) si vous voulez la connexion bancaire automatique.
PME avec équipe, fiduciaire et intégrations : bexio (dès CHF 35) - c'est là que son écosystème montre sa force.
Mobilité maximale, factures + notes de frais uniquement : Magic Heidi (CHF 25) avec ses apps natives.
Association ou adepte du desktop : Banana (CHF 89/an).
L'IA doit faire le travail (scanner les justificatifs, rapprocher la banque) : LumaBill Pro + IA (CHF 29) offre le paquet IA le plus complet : reconnaissance des justificatifs, catégorisation des dépenses, rapprochement bancaire et import depuis la boîte mail - plus un serveur MCP pour les assistants IA.
Conclusion
Il n'y a pas un vainqueur unique - mais des profils clairs. Si vous voulez des factures et une vraie comptabilité avec assistance IA à un prix équitable, LumaBill est en 2026 le meilleur choix de ce comparatif : comptabilité complète dès CHF 19, IA dès CHF 29, quatre langues. Testez LumaBill gratuitement pendant 14 jours - ou créez d'abord une QR-facture gratuite sans inscription pour découvrir l'expérience de facturation.
Tous les prix et indications de fonctions : sites des éditeurs, consultés le 10 juin 2026, en paiement annuel. Une erreur ? Écrivez-nous à support@lumabill.ch - nous corrigeons immédiatement.